Start End Size(bp) No._of_ORFs No._of_homologs_of_PAI-virulence_genes PAIs_homologous_to_this_region 230368 264830 34463 35 4 AGI-1 (Escherichia coli BEN2908) PAI II APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) tcd island (Photorhabdus luminescens W14) 330191 338389 8199 13 4 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) 1264391 1349921 85531 105 35 PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis 1002) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis C231) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis I19) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I CL3 (Escherichia coli CL3) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli 86-24) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Not named (Escherichia coli UMN026) Tn6060 (Pseudomonas aeruginosa 37308) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri M90T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-3 (Shigella boydii 0-1392) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 1920627 1935054 14428 13 6 PAI III 536 (Escherichia coli 536) KpGI-5 (Klebsiella pneumoniae KR116) SGI1 (Proteus mirabilis PmSCO) SGI1 (Proteus mirabilis PmABB) SGI1 (Proteus mirabilis PmVER) SGI1 (Proteus mirabilis PmGUE) 2582067 2612650 30584 41 6 PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) LEE (Escherichia coli 11128) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI IV 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) 3560805 3576291 15487 24 10 ETT2 (Escherichia coli 789) LIM (Escherichia coli O157:H7 Sakai) 3705241 3795254 90014 98 60 LEE (Citrobacter rodentium DBS100) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli E2348/69) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli 83/39) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli RDEC-1) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) LEE (Escherichia coli 11368) LEE (Escherichia coli 11128) LEE II (Escherichia coli 413/89-1) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) SESS LEE (Salmonella enterica S1296) SESS LEE (Salmonella enterica S1635) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) Not named (Yersinia pestis CO92) 5086080 5101472 15393 11 3 LEE (Escherichia coli 83/39) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) LEE (Escherichia coli 11368) LEE (Escherichia coli 11128) LEE II (Escherichia coli 413/89-1) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) 5170835 5180604 9770 14 1 LEE (Escherichia coli 12009) LEE (Escherichia coli 11128) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933)