Start End Size(bp) No._of_ORFs No._of_homologs_of_PAI-virulence_genes PAIs_homologous_to_this_region 1291171 1386830 95660 114 37 PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis 1002) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis C231) PiCp 7 (Corynebacterium pseudotuberculosis I19) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I CL3 (Escherichia coli CL3) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli 86-24) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI I CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) Not named (Escherichia coli UMN026) Tn6060 (Pseudomonas aeruginosa 37308) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri M90T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-3 (Shigella boydii 0-1392) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 2752136 2830610 78475 61 25 BcenGI11 (Burkholderia cenocepacia J2315) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI IV 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI I CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) Not named (Escherichia coli UMN026) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) HPI (Yersinia enterocolitica WA 314) HPI (Yersinia pestis 6/69) HPI (Yersinia pestis CO92) HPI (Yersinia pestis KIM) HPI (Yersinia pestis biovar Medievalis str. 91001) HPI (Yersinia pseudotuberculosis IP32953) HPI (Yersinia enterocolitica 8081) 3324187 3338692 14506 13 8 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 3876073 3898939 22867 31 10 LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) ETT2 (Escherichia coli 789) LIM (Escherichia coli O157:H7 Sakai) SPI-1 (Salmonella typhimurium LT2) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67) SSR-2 (Sodalis glossinidius ) 5322767 5387626 64860 64 48 LEE (Citrobacter rodentium DBS100) LEE (Escherichia coli E2348/69) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli 83/39) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli RDEC-1) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) LEE (Escherichia coli 11368) LEE (Escherichia coli 11128) LEE II (Escherichia coli 413/89-1) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) SESS LEE (Salmonella enterica S1296) SESS LEE (Salmonella enterica S1635) Not named (Yersinia pestis CO92) 5539977 5583190 43214 51 27 BcenGI11 (Burkholderia cenocepacia J2315) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) OI-122 (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI I CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000)