Start End Size(bp) No._of_ORFs No._of_homologs_of_PAI-virulence_genes PAIs_homologous_to_this_region 44659 86483 41825 54 18 AbaR1 (Acinetobacter baumannii AYE) AbaR26 (Acinetobacter baumannii D30) AbGRI2-1 (Acinetobacter baumannii WM99c) AbaR5 (Acinetobacter baumannii 3208) AbaR4e (Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715) Not named (Corynebacterium diphtheriae BH8) Not named (Corynebacterium urealyticum DSM 7109) PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Tn2411 (Escherichia coli 42) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) Tn5036-like (Klebsiella pneumoniae 12836) ICEPmu1 (Pasteurella multocida 36950) SGI1 (Proteus mirabilis PmBRI) SGI1 (Proteus mirabilis PmCAU) SGI1 (Proteus mirabilis PmSCO) SGI1 (Proteus mirabilis PmMAT) SGI1 (Proteus mirabilis PmABB) SGI1 (Proteus mirabilis PmVER) SGI1 (Proteus mirabilis PmGUE) Tn6060 (Pseudomonas aeruginosa 37308) PAGI-2 (Pseudomonas aeruginosa U6) PAGI-2(C) (Pseudomonas aeruginosa U09) SGI1 (Salmonella enterica DT104) SGI1 (Salmonella enterica SRC73) SGI2 (Salmonella enterica SRC19) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 814353 877530 63178 62 34 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I CL3 (Escherichia coli CL3) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 909427 921798 12372 11 2 TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) 1052861 1071354 18494 24 11 ETT2 (Escherichia coli 789) LIM (Escherichia coli O157:H7 Sakai) SPI-1 (Salmonella typhimurium LT2) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2) SPI-1 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67) SSR-2 (Sodalis glossinidius ) 1283482 1297086 13605 9 1 VPI-2 (Vibrio cholerae Amazonia 3509) VPI-2 (Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961) VPI-2 (Vibrio cholerae O395) 1973672 2050807 77136 65 24 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI IV 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) HPI (Yersinia enterocolitica WA 314) HPI (Yersinia pestis 6/69) HPI (Yersinia pestis CO92) HPI (Yersinia pestis KIM) HPI (Yersinia pestis biovar Medievalis str. 91001) HPI (Yersinia pseudotuberculosis IP32953) HPI (Yersinia enterocolitica 8081) 3187592 3219100 31509 34 9 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli ATCC43895) LEE (Escherichia coli 71074) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli O157:H7 EDL933) LEE (Escherichia coli O157:H7 Sakai) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) Tn6060 (Pseudomonas aeruginosa 37308) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 3232148 3240942 8795 11 3 PAI I CL3 (Escherichia coli CL3) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) 3254925 3279568 24644 24 9 TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI I CFT073 (Escherichia coli CFT073) Not named (Escherichia coli UMN026) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 4223232 4257664 34433 33 6 AGI-1 (Escherichia coli BEN2908) PAI II APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) tcd island (Photorhabdus luminescens W14) 4572616 4598356 25741 28 18 PAI I 536 (Escherichia coli 536) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 4602018 4630480 28463 29 5 AbaR1 (Acinetobacter baumannii AYE) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Tn2411 (Escherichia coli 42) SPI-7 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) 4773524 4833989 60466 48 23 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Not named (Escherichia coli UMN026) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri M90T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-3 (Shigella boydii 0-1392) SRL (Shigella flexneri YSH6000)