Start End Size(bp) No._of_ORFs No._of_homologs_of_PAI-virulence_genes PAIs_homologous_to_this_region 236088 248950 12863 18 1 PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) tcd island (Photorhabdus luminescens W14) 260391 292389 31999 42 12 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) 303837 314853 11017 13 5 PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) 372118 380627 8510 11 2 Not named (Escherichia coli Ec222) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI III APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) 1094332 1110047 15716 13 3 TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) 1141066 1203336 62271 64 35 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) KpGI-5 (Klebsiella pneumoniae KR116) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 2157027 2205297 48271 33 12 PAI IV 536 (Escherichia coli 536) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) HPI (Yersinia enterocolitica WA 314) HPI (Yersinia pseudotuberculosis IP32637) HPI (Yersinia pestis KIM6+) HPI (Yersinia pestis 6/69) HPI (Yersinia pestis CO92) HPI (Yersinia pestis KIM) HPI (Yersinia pestis biovar Medievalis str. 91001) HPI (Yersinia pseudotuberculosis IP32953) HPI (Yersinia enterocolitica 8081) 2272562 2307490 34929 36 12 PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 3293346 3312807 19462 28 14 AbaR1 (Acinetobacter baumannii AYE) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI I CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Tn2411 (Escherichia coli 42) Not named (Escherichia coli UMN026) SPI-7 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18) SHI-2 (Shigella flexneri M90T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) 3316685 3423733 107049 100 42 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli 84/110-1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) Not named (Escherichia coli UMN026) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-2 (Shigella flexneri M90T) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-2 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SHI-3 (Shigella boydii 0-1392) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 4145358 4166721 21364 23 7 PAI I 536 (Escherichia coli 536) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000) 4903949 4924373 20425 16 8 PAI I 536 (Escherichia coli 536) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) PAI I APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) LEE (Escherichia coli RW1374) LEE (Escherichia coli 12009) AGI-3 (Escherichia coli BEN2908) PAI II 536 (Escherichia coli 536) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) TAI (Escherichia coli O157:H7 EDL933) PAI III 536 (Escherichia coli 536) PAI V 536 (Escherichia coli 536) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI II CFT073 (Escherichia coli CFT073) PAI-I AL862 (Escherichia coli AL862) PAI IV APEC-O1 (Escherichia coli APEC O1) SHI-1 (Shigella flexneri YSH6000T) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 301) SHI-1 (Shigella flexneri 2a str. 2457T) SRL (Shigella flexneri YSH6000)